RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442343.1

RPSAP40-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 40, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP40, Length 891 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 POU2AF1Q16633 256 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 TPRX1Q8N7U7 411 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF709Q8N972 641 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 Q8N9W7 124 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 OR4S2Q8NH73 311 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF503Q96F45 646 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RBKSQ9H477 322 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RPRMQ9NS64 109 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 GNG12Q9UBI6 72 aa4.87□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 HSPG2P98160 4391 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 LINC01619G3V211 115 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 H3BP45 60 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 CYB5BO43169 146 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 S1PR2O95136 353 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 LY6G6CO95867 125 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 KRASP01116 189 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 OR13C7P0DN81 318 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 CGB3P0DN86 165 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 CGB7P0DN87 165 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 NQO2P16083 231 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 NFYBP25208 207 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 SSTR5P35346 364 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 G6PCP35575 357 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 PSMB3P49720 205 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RND2P52198 227 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 GNB1P62873 340 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 DLK1P80370 383 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 HNF4GQ14541 408 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 C17orf58Q2M2W7 97 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 DNLZQ5SXM8 178 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 FAM71F2Q6NXP2 309 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 OR2T10Q8NGZ9 312 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 YPEL4Q96NS1 127 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 OR4C12Q96R67 309 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 S1PR3Q99500 378 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RSG1Q9BU20 258 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 GNB4Q9HAV0 340 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 GNG13Q9P2W3 67 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.86□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 C5orf52A6NGY3 159 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 PDE6DO43924 150 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 KBTBD11O94819 623 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 CD1BP29016 333 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RAB9AP51151 201 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RAB11AP62491 216 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RPL30P62888 115 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RAB31Q13636 194 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 MORN2Q502X0 79 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 OR4A16Q8NH70 328 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 C5orf30Q96GV9 206 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RARRES2Q99969 163 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 KLK15Q9H2R5 256 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 CALYQ9NYX4 217 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 NAT8Q9UHE5 227 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 PSG11Q9UQ72 335 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 HERC1Q15751 4861 aa4.85□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 NUPR2A6NF83 97 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 ZFP92A6NM28 416 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 C15orf61A6NNL5 157 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 F6UZH7 168 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 M0R1X1 148 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 PROP1O75360 226 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 MOSP00540 346 aa4.84□□□□□ -1.63
RPSAP40-201ENST00000442343 HRASP01112 189 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms