RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.38□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 ZNF320A2RRD8 509 aa9.37□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 SULT1A2P50226 295 aa9.37□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.37□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 SLC25A22Q9H936 323 aa9.35□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
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