RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 OCM2P0CE71 109 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPCS3P61009 180 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 COX6A2Q02221 97 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C19orf60Q96EN9 201 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C20orf27Q9GZN8 174 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 IQCF5A8MTL0 148 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRN3E7EW58 273 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 H0Y980 276 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SULT1C4O75897 302 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMIM17P0DL12 118 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ETV6P41212 452 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 MED21Q13503 144 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C1orf134Q5TEV5 83 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARPINQ7Z6K5 226 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C2orf50Q96LR7 162 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RFX7Q2KHR2 1363 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYCBP2O75592 4640 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A087WSZ3 146 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR4C46A6NHA9 309 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 HAND1O96004 215 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR10J4P0C629 311 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSMB6P28072 239 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE2G2P60604 165 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 LYRM7Q5U5X0 104 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 XAF1Q6GPH4 301 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 S100A7AQ86SG5 101 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM9CQ8IZT9 166 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 MALSU1Q96EH3 234 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARL5AQ9Y689 179 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUP98P52948 1817 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNXBP22105 4242 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV27A0A087WT01 109 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 C9orf170A2RU37 121 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 A8MT66 165 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 B4DSR2 109 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC16A4O15374 487 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 DCTN3O75935 186 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 EVI2AP22794 236 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 BCL2L15Q5TBC7 163 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 C22orf39Q6P5X5 142 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC18Q8N456 261 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR5D16Q8NGK9 328 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 UCK1Q9HA47 277 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIF1BO60333 1816 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 KMT2AQ03164 3969 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ROBO3Q96MS0 1386 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYO7AQ13402 2215 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM159BA6NKW6 160 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDE6GP18545 87 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB5CP51148 216 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 RANP62826 216 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMED1Q13445 227 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF56Q15929 161 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIST3H3Q16695 136 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM86BQ8N661 226 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC25A40Q8TBP6 338 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM126AQ9H061 195 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TVP23BQ9NYZ1 205 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 NCOA1Q15788 1441 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CALB1P05937 261 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPRR2DP22532 72 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRIP30626 198 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFA3P59666 94 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE2BP63146 152 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SKP1P63208 163 aa-0.76□□□□□ -2.53
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