RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PRE2 83 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 GLOD5A6NK44 160 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 C17orf51A8MQB3 221 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF878C9JN71 531 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 M0R2Z0 102 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 SYNGR2O43760 224 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 HSBP1O75506 76 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV1-39P01597 117 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV1D-39P04432 117 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 C8orf89P0DMQ9 161 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF32P17041 273 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 EVI2AP22794 236 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 CFHR2P36980 270 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 MPV17P39210 176 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OR1D4P47884 311 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 UQCRFS1P47985 274 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 RPL31P62899 125 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 SLC35B1P78383 322 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 TAL2Q16559 108 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 POU2AF1Q16633 256 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LGALS9BQ3B8N2 356 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ABCA11PQ4W5N1 156 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 PHLDA2Q53GA4 152 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LGALS9CQ6DKI2 356 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 C22orf39Q6P5X5 142 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00696Q6ZRV3 163 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf201Q7Z4U5 140 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 MARCH3Q86UD3 253 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM251Q8N6I4 163 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 VN1R2Q8NFZ6 395 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OR8B12Q8NGG6 310 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 IL1F10Q8WWZ1 152 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OXGR1Q96P68 337 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01587Q99440 93 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A22Q9H936 323 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 MTCH1Q9NZJ7 389 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 WDR83OSQ9Y284 106 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 MPC1Q9Y5U8 109 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 R4GN57 208 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 PRSS46E5RG02 174 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 H3BSH0 61 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FCN3O75636 299 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 LY6G6DO95868 133 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CXorf1O96002 111 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CA1P00915 261 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TGFAP01135 160 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CT62P0C5K7 136 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CISD3P0C7P0 127 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SMIM13P0DJ93 91 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 PRTN3P24158 256 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 INSL3P51460 131 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FBXW4P57775 412 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 HERV-K104P61576 105 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 KISS1Q15726 138 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CEACAM16Q2WEN9 425 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ETDBQ3ZM63 59 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ACP7Q6ZNF0 438 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 OR10G6Q8NH81 332 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 AP1S3Q96PC3 154 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 NPCDR1Q9BY65 106 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SPANXCQ9NY87 97 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 PILRAQ9UKJ1 303 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 KNTC1P50748 2209 aa2.64□□□□□ -1.99
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