RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 LOXL3P58215 753 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 PLCE1Q9P212 2302 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 GATA3P23771 443 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 COL8A1P27658 744 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 H3BTX0 84 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 MGST3O14880 152 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 ORM2P19652 201 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 NMUP48645 174 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 ATP5G2Q06055 141 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 WFDC2Q14508 124 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 FXYD5Q96DB9 178 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-201ENST00000331563 F8W1H4 67 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 C2orf83Q53S99 150 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 PSG8Q9UQ74 426 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 DYSFO75923 2080 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 CRYGCP07315 174 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 CALYQ9NYX4 217 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 IGHG3P01860 377 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 NPIPB3Q92617 1050 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 DPF1Q92782 380 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 TPPP3Q9BW30 176 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 UPK2O00526 184 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 SMIM13P0DJ93 91 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ZNF714Q96N38 554 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 POLEQ07864 2286 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 IGKV1-16P04430 117 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 PATE2Q6UY27 113 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 SIVA1O15304 175 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ETDBQ3ZM63 59 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 CT83Q5H943 113 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 CACNG7P62955 275 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 DLL1O00548 723 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 GCSHP23434 173 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 FOXC1Q12948 553 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 RNF183Q96D59 192 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 MLST8Q9BVC4 326 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 DKK4Q9UBT3 224 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 FXYD7P58549 80 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 HERV-K104P63124 156 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 RND1Q92730 232 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 FAM106CPP0CH98 169 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 PCP2Q8IVA1 136 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 FMC1Q96HJ9 113 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ERG28Q9UKR5 140 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 A0A1B0GUT8 65 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 HAX1O00165 279 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 ARPC1AQ92747 370 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP3-201ENST00000331563 SPINK8P0C7L1 97 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms