RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318023.11

CAPN3-201, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPN3, Length 3,172 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-201ENST00000318023 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 RTL8BQ17RB0 113 aa7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 AMTNQ6UX39 209 aa7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 OR11H1Q8NG94 326 aa7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 OR11H2Q8NH07 326 aa7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 MGST2Q99735 147 aa7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 VGLL1Q99990 258 aa7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 LRRC30A6NM36 301 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 CA6P23280 308 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 CFHR2P36980 270 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ZNF137PP52743 207 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 SPTSSAQ969W0 71 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 IGLV2-8P01709 118 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 GCSHP23434 173 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ID1P41134 155 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 PSG5Q15238 335 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 Q96MF0 132 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ZNF488Q96MN9 340 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 C1RLQ9NZP8 487 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 AKAP9Q99996 3911 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 C15orf62A8K5M9 175 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 HIGD1CA8MV81 97 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 LIPFP07098 398 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 LINC00205P59089 165 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 CR1LQ2VPA4 569 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 TREML4Q6UXN2 200 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 GALMQ96C23 342 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ERG28Q9UKR5 140 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 NGFP01138 241 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 PLP2Q04941 152 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 EFNB3Q15768 340 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 Q6ZS49 121 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 DRAM1Q8N682 238 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 MSMPQ1L6U9 139 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 PCP2Q8IVA1 136 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 SYT8Q8NBV8 401 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 NMUP48645 174 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 FXYD2P54710 66 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 LINC01545Q5VT33 79 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 NF1P21359 2839 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 GGTLC3B5MD39 225 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 RNF223E7ERA6 249 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 SMIM13P0DJ93 91 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 TMEM54Q969K7 222 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 NABP1Q96AH0 204 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 OPRK1P41145 380 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 OR2J3O76001 311 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 XGP55808 180 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 CCL8P80075 99 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 GAGE5Q13069 117 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 GAGE6Q13070 117 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 OR4A16Q8NH70 328 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 SGK494Q96LW2 274 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 TAS2R45P59539 299 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 FHL3Q13643 280 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 ADIPOQQ15848 244 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 GLMPQ8WWB7 406 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 GPR82Q96P67 336 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 A0A1W2PRD5 423 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 A0A1W2PRF3 423 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 A0A1W2PRM7 423 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 SPRY3O43610 288 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 OR5AL1P0C617 328 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 TMEM42Q69YG0 159 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 Q6ZSR3 168 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPN3-201ENST00000318023 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.54□□□□□ -1.2
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