RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 PMS2P5A8MQ11 134 aa12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ZGRF1Q86YA3 2104 aa12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 UBE2L6O14933 153 aa12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IGKV1D-33P01593 117 aa12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IGKV1-33P01594 117 aa12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF114Q8NC26 417 aa12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SLC25A2Q9BXI2 301 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 MLANAQ16655 118 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TCRAP04437 139 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CHAC1Q9BUX1 264 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 LINC00473A8K010 186 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CD24P25063 80 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 MOB4Q9Y3A3 225 aa12.76□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SMKR1H3BMG3 65 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 GFRA3O60609 400 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IQCF6A8MYZ5 107 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CCL25O15444 150 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IGHV1-2P23083 117 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 B3GALT5-AS1P59052 145 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 RNF115Q9Y4L5 304 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IGKV1-39P01597 117 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IGKV1D-39P04432 117 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ASCL2Q99929 193 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CITED1Q99966 193 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SMPXQ9UHP9 88 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 MED13Q9UHV7 2174 aa12.75□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 AMN1Q8IY45 258 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PROK2Q9HC23 129 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TM4SF5O14894 197 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PLNP26678 52 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TEX43Q6ZNM6 134 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ATP5G2Q06055 141 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 WFDC12Q8WWY7 111 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.74□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 GLMPQ8WWB7 406 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 FOXC1Q12948 553 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SLAQ13239 276 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TDRG1Q3Y452 100 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PRSS57Q6UWY2 283 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 C9orf118A6NHY6 69 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 F2Z2F3 143 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 CDKN1BP46527 198 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ASCL4Q6XD76 172 aa12.73□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 HAPLN4Q86UW8 402 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 PPP1R27Q86WC6 154 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 LYPD6BQ8NI32 183 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 DPM3Q9P2X0 92 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 GTF3C1Q12789 2109 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 H3BRM9 83 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 ASPHD1Q5U4P2 390 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 AZU1P20160 251 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM238C9JI98 176 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IL18BPO95998 194 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 C8orf46Q8TAG6 207 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM158Q8WZ71 300 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 RAX2Q96IS3 184 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.72□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 FAM106AQ4KMX7 169 aa12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 FAM27E3Q08E93 113 aa12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 RCHY1Q96PM5 261 aa12.71□□□□□ -0.37
KCNS1-201ENST00000306117 DYSFO75923 2080 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 C9JAW5 83 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 NPFFO15130 113 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 ARMS2P0C7Q2 107 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 LAGE3Q14657 143 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 LY6EQ16553 131 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 VWC2Q2TAL6 325 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 RNF182Q8N6D2 247 aa12.71□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNS1-201ENST00000306117 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms