RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 GAGE12BA1L429 117 aa8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 HELTA6NFD8 242 aa8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 MFAP4P55083 255 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 PAX2Q02962 417 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 FSTL3O95633 263 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF726P1Q15940 193 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.57□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.57□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.57□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 IGHV3-11P01762 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV2-5P01817 119 aa8.56□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 SLC25A16P16260 332 aa8.56□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 ATP5G3P48201 142 aa8.56□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.55□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 PLA2G2AP14555 144 aa8.55□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.54□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 FCER1GP30273 86 aa8.54□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 KLRD1Q13241 179 aa8.54□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 UTF1Q5T230 341 aa8.54□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PPI3 338 aa8.54□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 B5MCH6 92 aa8.53□□□□□ -1.04
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PRRX1-201ENST00000239461 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 DSCAMO60469 2012 aa8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 DLX6P56179 175 aa8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-201ENST00000239461 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.53□□□□□ -1.04
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