RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.6□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 APCP25054 2843 aa14.6□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.59□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 G3V318 75 aa14.59□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 ESDP10768 282 aa14.59□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 IER3P46695 156 aa14.59□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.59□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 NAGKQ9UJ70 344 aa14.59□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 GNG7O60262 68 aa14.58□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 SLC25A16P16260 332 aa14.58□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 TPPP2P59282 170 aa14.58□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.58□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.58□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.58□□□□□ -0.07
SIKE1-201ENST00000060969 AMY1AP04745 511 aa14.58□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 GP9P14770 177 aa14.58□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 Q56UQ5 140 aa14.58□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 C21orf62Q9NYP8 219 aa14.58□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.58□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 A0A1B0GV90 55 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 SNURFLB1AK76 121 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 ISLRO14498 428 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 MFAP4P55083 255 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 RANP62826 216 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 Q0VG73 95 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 LY6EQ16553 131 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 COX19Q49B96 90 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 LINC00479Q96M42 142 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 OR2T8A6NH00 312 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 IL4P05112 153 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 WDR73Q6P4I2 378 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF329Q86UD4 541 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.57□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 TOMM40O96008 361 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 MT-ND6P03923 174 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 IGLV2-8P01709 118 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 LINC00310P59036 64 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 GNG5P63218 68 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 BAGE3Q86Y29 109 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 BAGE2Q86Y30 109 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 RNF125Q96EQ8 232 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 THYN1Q9P016 225 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.56□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 SERF1AO75920 110 aa14.55□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.55□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 FOSL1P15407 271 aa14.55□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 TAS2R60P59551 318 aa14.55□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 SSTP61278 116 aa14.55□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 RNF223E7ERA6 249 aa14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 H3BUX3 64 aa14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 MYCNOSP40205 109 aa14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 C15orf32Q32M92 178 aa14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.54□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 RHOGP84095 191 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 CTSGP08311 255 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 Q6ZWC4 215 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.53□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 PEX7O00628 323 aa14.52□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.52□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.52□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.52□□□□□ -0.08
SIKE1-201ENST00000060969 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.51□□□□□ -0.09
SIKE1-201ENST00000060969 PGPA6NDG6 321 aa14.51□□□□□ -0.09
SIKE1-201ENST00000060969 H3BRN7 92 aa14.51□□□□□ -0.09
SIKE1-201ENST00000060969 TGFAP01135 160 aa14.51□□□□□ -0.09
SIKE1-201ENST00000060969 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SIKE1-201ENST00000060969 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.51□□□□□ -0.09
SIKE1-201ENST00000060969 CR1P17927 2039 aa14.51□□□□□ -0.09
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms