RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	MTMR6	Q9Y217	621 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	C6orf229	H3BNL8	230 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	ALDH1B1	P30837	517 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	MASTL	Q96GX5	879 aa		18.77	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	LTBP1	Q14766	1721 aa		18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	IL1R1	P14778	569 aa		18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	OLFM4	Q6UX06	510 aa		18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	18.77	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	F13A1	P00488	732 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	GRIK5	Q16478	980 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	PDC	P20941	246 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	PPARA	Q07869	468 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		18.76	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CTDNEP1	O95476	244 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	IGSF3	O75054	1194 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	KDM4A	O75164	1064 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	BAG6	P46379	1132 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	18.74	■□□□□ 0.59	7e-7	■□□□□ 9.9
DNM1-222	ENST00000636280	DDX11	Q96FC9	970 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	SMIM22	K7EJ46	135 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	MPND	Q8N594	471 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	KRT23	Q9C075	422 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		18.74	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM87B	Q96K49	555 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	RIMBP2	O15034	1052 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	TOMM22	Q9NS69	142 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280		H0YIN7	160 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CTR9	Q6PD62	1173 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	SENP2	Q9HC62	589 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CHD4	Q14839	1912 aa		18.72	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	GSTO1	P78417	241 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		18.71	■□□□□ 0.59
DNM1-222	ENST00000636280	USP17L12	C9JPN9	530 aa		18.71	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	USP17L21	D6R901	530 aa		18.71	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		18.71	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.71	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	STYK1	Q6J9G0	422 aa		18.71	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	LY9	Q9HBG7	655 aa		18.71	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		18.71	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		18.7	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	PPFIA3	O75145	1194 aa		18.7	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
DNM1-222	ENST00000636280	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		18.7	■□□□□ 0.58

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