RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 BRCA2P51587 3418 aa34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP5BP32019 993 aa34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMC4P43686 418 aa34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 HHIPL2Q6UWX4 724 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 RAET1EQ8TD07 263 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PDHXO00330 501 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXD10P28358 340 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf99Q6UX52 265 aa34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TCP10Q12799 353 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MTFR1Q15390 333 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD23Q86SG2 305 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 DPF3Q92784 378 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SRRDQ9UH36 339 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ANP32CO43423 234 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM151AQ8WW52 585 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A1P13866 664 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR66Q8TBY9 1149 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM47Q96LD4 638 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPP22059 807 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRDL2Q6WN34 429 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF16BQ96L93 1317 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CTGFP29279 349 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 GRK4P32298 578 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 MYPNQ86TC9 1320 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FGFR2P21802 821 aa34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX2-3Q8TAU0 364 aa34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SHISA4Q96DD7 197 aa34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM9BQ8IZU0 186 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNH4Q9UQ05 1017 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 DIXDC1Q155Q3 683 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 LPIN2Q92539 896 aa34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF112Q9UJU3 913 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 EYA2O00167 538 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL5P13501 91 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 NFIAQ12857 509 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRA2Q96PE1 1338 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 UBXN2AP68543 259 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF208Q9H0X6 261 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 USP40Q9NVE5 1235 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRCP08575 1304 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 FCGRTP55899 365 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HTATIP2Q9BUP3 242 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-217ENST00000629983 LDHBP07195 334 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDX5P30044 214 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKCZQ05513 592 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 USP44Q9H0E7 712 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GJB1P08034 283 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2C8P10632 490 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GJA8P48165 433 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 MOGSQ13724 837 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP290O15078 2479 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM198AQ9UFP1 575 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SIL1Q9H173 461 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PICK1Q9NRD5 415 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL11O14625 94 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP2B3Q16720 1220 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GPAT2Q6NUI2 795 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GADL1Q6ZQY3 521 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SLAIN1Q8ND83 568 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-217ENST00000629983 BCRP11274 1271 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFPM1Q8IX07 1006 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ZHX2Q9Y6X8 837 aa34.13■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
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CAPNS1-217ENST00000629983 SCYL3Q8IZE3 742 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP126Q9P2H0 1117 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRQQ9UN88 632 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 NR2E3Q9Y5X4 410 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG9AQ7Z3C6 839 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 SSH1Q8WYL5 1049 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC93B1Q9H1C4 597 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS3P49796 1198 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND2AQ9ULE3 1009 aa34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCY3O60266 1144 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-217ENST00000629983 AK9Q5TCS8 1911 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRAP18433 802 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PHKA1P46020 1223 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
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