RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625728.1

GTF3C2-AS1-212, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 726 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.13■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.13■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 RHBDL3P58872 404 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PRKG1Q13976 671 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 BCL11AQ9H165 835 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 LAMB1P07942 1786 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SIPA1L1O43166 1804 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 FOCADQ5VW36 1801 aa18.12■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 BTDP43251 543 aa18.11■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.11■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.11■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 ATRNL1Q5VV63 1379 aa18.11■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SLC10A3P09131 477 aa18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 FKBP1BP68106 108 aa18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 GRM1Q13255 1194 aa18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 MAP3K11Q16584 847 aa18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 RGMBQ6NW40 437 aa18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 RAI14Q9P0K7 980 aa18.1■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SLURP2P0DP57 97 aa18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 TNFAIP1Q13829 316 aa18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 USP40Q9NVE5 1235 aa18.09■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.08■□□□□ 0.49
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 CHGBP05060 677 aa18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 TCP10Q12799 353 aa18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 FAM83AQ86UY5 434 aa18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 IGHDP01880 384 aa18.07■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 IDI2Q9BXS1 227 aa18.07■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 NF2P35240 595 aa18.06■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 ECE1P42892 770 aa18.06■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 RGS3P49796 1198 aa18.06■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.06■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 FAM151AQ8WW52 585 aa18.06■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.06■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 MYH7P12883 1935 aa18.06■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 ATP5JP18859 108 aa18.05■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 GJA5P36382 358 aa18.05■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 WBP1LQ9NX94 342 aa18.05■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.05■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 GOLIM4O00461 696 aa18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 TNNI2P48788 182 aa18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 ARMC9Q7Z3E5 817 aa18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 HAUS7Q99871 368 aa18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.03■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 FOXN1O15353 648 aa18.03■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 GSTO1P78417 241 aa18.03■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PICALMQ13492 652 aa18.03■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.03■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SLF2Q8IX21 1173 aa18.03■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.03■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 ENTPD3O75355 529 aa18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 CYP7A1P22680 504 aa18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PPP4CP60510 307 aa18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 SMC5Q8IY18 1101 aa18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.02■□□□□ 0.48
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 LDHCP07864 332 aa18.01■□□□□ 0.47
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 PDE6AP16499 860 aa18.01■□□□□ 0.47
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 MAP2K2P36507 400 aa18.01■□□□□ 0.47
GTF3C2-AS1-212ENST00000625728 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms