RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.49	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT32	Q14532	448 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	PLIN2	Q99541	437 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	APPBP2	Q92624	585 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	STAM	Q92783	540 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	FGA	P02671	866 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	USP5	P45974	858 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	ST5	P78524	1137 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	SERPINB2	P05120	415 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	PRC1	O43663	620 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	CACNB3	P54284	484 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE6A	P16499	860 aa		11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SCNN1D	P51172	638 aa		11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TCP10	Q12799	353 aa		11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.46	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	FGFR2	P21802	821 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1B0GVL5	298 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM196B	A6NMK8	535 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ADRA2B	P18089	450 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	STK38	Q15208	465 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TSC1	Q92574	1164 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	BTAF1	O14981	1849 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	BECN2	A8MW95	431 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	NMT2	O60551	498 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	GYS1	P13807	737 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ADD2	P35612	726 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC14	Q96N46	770 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ERICH2	A1L162	156 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232		E7EWF7	191 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC69	A6NI79	296 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.43	□□□□□ -0.58

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