RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	GCGR	P47871	477 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	NECAB1	Q8N987	351 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	DISP2	A7MBM2	1401 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	POTEC	B2RU33	542 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408		H3BQV1	296 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRR20E	P86478	221 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRR20C	P86479	221 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRR20D	P86480	221 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRR20B	P86481	221 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRR20A	P86496	221 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	ST3GAL1	Q11201	340 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408		Q6ZUG5	572 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-222	ENST00000592408	PFKFB2	O60825	505 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP21A2	P08686	494 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC192	P0DO97	292 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATL3	Q6DD88	541 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CFAP45	Q9UL16	551 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAST3	O60307	1309 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	TPM3	P06753	285 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	TPM2	P07951	284 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP6V1A	P38606	617 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRP5	O75197	1615 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	BCL9	O00512	1426 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CAVIN2	O95810	425 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CSF1R	P07333	972 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	STK3	Q13188	491 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC24	Q50LG9	513 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	METTL24	Q5JXM2	366 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	FBXL16	Q8N461	479 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	APPBP2	Q92624	585 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	BRF1	Q92994	677 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATRN	O75882	1429 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ITGB4	P16144	1822 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CTSW	P56202	376 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	TIMM10	P62072	90 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	PIGB	Q92521	554 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	BTG4	Q9NY30	223 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		10.79	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms