RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR66Q8TBY9 1149 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 GCC1Q96CN9 775 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF341Q9BYN7 854 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP5BP32019 993 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SLFN5Q08AF3 891 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM106CQ9BVX2 250 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 DIXDC1Q155Q3 683 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM151AQ8WW52 585 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDX5P30044 214 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 PPATQ06203 517 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP10Q12799 353 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 NFIAQ12857 509 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH1L2Q3SY69 923 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF11Q86T75 865 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SIL1Q9H173 461 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SMC4Q9NTJ3 1288 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 MYCP01106 439 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF22Q14807 665 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3TC2Q8TF17 1288 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 CDCA7LQ96GN5 454 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF112Q9UJU3 913 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP2B3Q16720 1220 aa32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CIAO1O76071 339 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM198AQ9UFP1 575 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH13Q9UKX3 1938 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf99Q6UX52 265 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CPA4Q9UI42 421 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO3Q9UK99 471 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNH4Q9UQ05 1017 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 LDHBP07195 334 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CTGFP29279 349 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD23Q86SG2 305 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PDHXO00330 501 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PHKA1P46020 1223 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 MOGSQ13724 837 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 USP40Q9NVE5 1235 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRA2Q96PE1 1338 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 SALL1Q9NSC2 1324 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 GNRH1P01148 92 aa31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFPM1Q8IX07 1006 aa31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND2AQ9ULE3 1009 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ATRNL1Q5VV63 1379 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA3EO15041 775 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ADORA1P30542 326 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 IL15P40933 162 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMC4P43686 418 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PRMT2P55345 433 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM47Q96LD4 638 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC102BQ68D86 513 aa31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SRRDQ9UH36 339 aa31.91■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPP22059 807 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 RFX7Q2KHR2 1363 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF20L1A8MW92 1017 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS3P49796 1198 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 MTFR1Q15390 333 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 GPAT2Q6NUI2 795 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 MEIS3Q99687 375 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 IDI2Q9BXS1 227 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 COPRSQ9NQ92 184 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 GAKO14976 1311 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB22O15209 634 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGRF1Q13972 1273 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2C8P10632 490 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SHISA4Q96DD7 197 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
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CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL11O14625 94 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ENTPD3O75355 529 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SCYL3Q8IZE3 742 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 MYPNQ86TC9 1320 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SLURP2P0DP57 97 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 BCRP11274 1271 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXD10P28358 340 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM10P62072 90 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 RAET1EQ8TD07 263 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
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