RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GIPC1-210ENST00000589497 SLC10A3P09131 477 aa23.12■■□□□ 1.29
GIPC1-210ENST00000589497 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
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GIPC1-210ENST00000589497 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.12■■□□□ 1.29
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GIPC1-210ENST00000589497 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.12■■□□□ 1.29
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GIPC1-210ENST00000589497 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 INHBEP58166 350 aa22.98■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.98■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.98■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 GPATCH3Q96I76 525 aa22.98■■□□□ 1.27
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