RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582416.5

DRC3-213, Transcript of dynein regulatory complex subunit 3, human

TSL 5

Gene DRC3, Length 541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DRC3-213	ENST00000582416	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.25	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	GAK	O14976	1311 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	LAMB1	P07942	1786 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	CAPN15	O75808	1086 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	NFIA	Q12857	509 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	VGLL4	Q14135	290 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	GPR25	O00155	361 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	MCAM	P43121	646 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	OPTN	Q96CV9	577 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	PTPN18	Q99952	460 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DRC3-213	ENST00000582416	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	MECOM	Q03112	1051 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	ENTPD3	O75355	529 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	RHBDL3	P58872	404 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	TCP10	Q12799	353 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	CSAD	Q9Y600	493 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	IGSF3	O75054	1194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	RGS3	P49796	1198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DRC3-213	ENST00000582416	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms