RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 RAP1GAPP47736 663 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 POU4F3Q15319 338 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP4Q5JQC9 854 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 LILRA6Q6PI73 481 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 PCDH1Q08174 1060 aa4.38□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 A6NHS1 94 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 PRRG2O14669 202 aa4.37□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.37□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.37□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 HELQQ8TDG4 1101 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 CORO1BQ9BR76 489 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 NCANO14594 1321 aa4.37□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 SEPT3Q9UH03 358 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 B8ZZF3 427 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 LGR6Q9HBX8 967 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 ATP2B4P23634 1241 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 MLANAQ16655 118 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 TICAM2Q86XR7 235 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 ARID3AQ99856 593 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 POLIQ9UNA4 740 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRM-204ENST00000577468 CDK5R2Q13319 367 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa4.33□□□□□ -1.72
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PTPRM-204ENST00000577468 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 WDR18Q9BV38 432 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PIDD1Q9HB75 910 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ECEL1O95672 775 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 CEACAM5P06731 702 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 SLFN14P0C7P3 912 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 GRIA4P48058 902 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 AP3B2Q13367 1082 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PDE3AQ14432 1141 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.32□□□□□ -1.72
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