RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 RASSF10A6NK89 507 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 MEN1O00255 615 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 STARD3NLO95772 234 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP2R1AP30153 589 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRKAR2BP31323 418 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 NFIXQ14938 502 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF790Q6PG37 636 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM122AQ96E09 287 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 NLRP3Q96P20 1036 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPINT1O43278 529 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHRNA5P30532 468 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLDN10P78369 228 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCDC102BQ68D86 513 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 XAGE2Q96GT9 111 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNX27Q96L92 541 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SENP2Q9HC62 589 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUDCQ9Y266 331 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUP98P52948 1817 aa6.71□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A087WZG4 1122 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 BTBD11A6QL63 1104 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 POTECB2RU33 542 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 LCE2BO14633 110 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CA12O43570 354 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERPINB2P05120 415 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 GDF10P55107 478 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.344e-6■□□□□ 8.3
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLN3Q13286 438 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CNKSR1Q969H4 720 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CAPNS2Q96L46 248 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLX4Q8IY92 1834 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM196BA6NMK8 535 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 BACH1O14867 736 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 KCNQ3O43525 872 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 A1BGP04217 495 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 INHAP05111 366 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLA2G5P39877 138 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ECE1P42892 770 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PTK7Q13308 1070 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIFC2Q96AC6 838 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PASKQ96RG2 1323 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTLL8A6PVC2 850 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L15C9J2P7 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L10C9JJH3 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L12C9JPN9 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L11C9JVI0 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L21D6R901 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L18D6R9N7 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L22D6RA61 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L19D6RCP7 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L20D6RJB6 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CAMTA2O94983 1202 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 IL2RAP01589 272 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SCNN1DP51172 638 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 CENPCQ03188 943 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP17L24Q0WX57 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 MCM10Q7L590 875 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP16Q9Y5T5 823 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 H0YIN7 160 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATG7O95352 703 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPC1P35052 558 aa6.67□□□□□ -1.34
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