RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576613.5

CTDNEP1-212, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTDNEP1, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-212ENST00000576613 HOXD10P28358 340 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 BCAMP50895 628 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 CEP290O15078 2479 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 H0YGN5 161 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 C17orf99Q6UX52 265 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 FAM151AQ8WW52 585 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 AK9Q5TCS8 1911 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 PDHXO00330 501 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 ANP32CO43423 234 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 SLC5A1P13866 664 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 INPP5BP32019 993 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 PSMC4P43686 418 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 RAET1EQ8TD07 263 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 TRIM47Q96LD4 638 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 SRRDQ9UH36 339 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 CPA4Q9UI42 421 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 PTPRCP08575 1304 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-212ENST00000576613 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 FGFR2P21802 821 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 GRK4P32298 578 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 LPIN2Q92539 896 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 OSBPP22059 807 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 TCP10Q12799 353 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 MTFR1Q15390 333 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 DPF3Q92784 378 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 MYPNQ86TC9 1320 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 FCGRTP55899 365 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 SHISA4Q96DD7 197 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 DOCK2Q92608 1830 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 MGAMO43451 1857 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 EYA2O00167 538 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 GJB1P08034 283 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 CCL5P13501 91 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 CTGFP29279 349 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 GJA8P48165 433 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 UBXN2AP68543 259 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 CXCL11O14625 94 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 NFIAQ12857 509 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 USP44Q9H0E7 712 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 RNF208Q9H0X6 261 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 PRDX5P30044 214 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 PRKCZQ05513 592 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 MOGSQ13724 837 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 PICK1Q9NRD5 415 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 USP40Q9NVE5 1235 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 FBXO3Q9UK99 471 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 SZT2Q5T011 3432 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.52□□□□□ -0.08
CTDNEP1-212ENST00000576613 SEMA3EO15041 775 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 CYP2C8P10632 490 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 BCRP11274 1271 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 ATP2B3Q16720 1220 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZNF521Q96K83 1311 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 CAPN2P17655 700 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 DOCK1Q14185 1865 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-212ENST00000576613 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms