RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	AFF2	P51816	1311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	REC8	O95072	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	HSPA6	P17066	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	IGFBP4	P22692	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	IL13	P35225	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	DDIT3	P35638	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	NUCB2	P80303	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MTFR1	Q15390	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TNR	Q92752	1358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	USP6	P35125	1406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346		A0A1B0GTH6	734 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	C2CD2L	O14523	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	FOXO3	O43524	673 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	VAMP4	O75379	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ITGB7	P26010	798 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MCM2	P49736	904 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	AOX1	Q06278	1338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	FLT4	P35916	1363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SLIT1	O75093	1534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	LRP6	O75581	1613 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	LGR5	O75473	907 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MET	P08581	1390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MCC	P23508	829 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	WEE1	P30291	646 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	KDR	P35968	1356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	KCNA1	Q09470	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MSH6	P52701	1360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GNAI3	P08754	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SSFA2	P28290	1259 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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