RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC40-211ENST00000574099 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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CCDC40-211ENST00000574099 WDR63Q8IWG1 891 aa22.08■■□□□ 1.13
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CCDC40-211ENST00000574099 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC40-211ENST00000574099 RNF208Q9H0X6 261 aa22.05■■□□□ 1.12
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CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC40-211ENST00000574099 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.04■■□□□ 1.12
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CCDC40-211ENST00000574099 MOGSQ13724 837 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-211ENST00000574099 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-211ENST00000574099 FAM151AQ8WW52 585 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-211ENST00000574099 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-211ENST00000574099 MRIQ9BWK5 157 aa22.03■■□□□ 1.12
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CCDC40-211ENST00000574099 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC40-211ENST00000574099 UTYO14607 1347 aa22.03■■□□□ 1.12
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CCDC40-211ENST00000574099 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.01■■□□□ 1.11
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CCDC40-211ENST00000574099 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.98■■□□□ 1.11
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CCDC40-211ENST00000574099 DOCK1Q14185 1865 aa21.94■■□□□ 1.1
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CCDC40-211ENST00000574099 ALPK3Q96L96 1907 aa21.93■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 PICK1Q9NRD5 415 aa21.93■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.93■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.92■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CCDC40-211ENST00000574099 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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