RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 PRMT2P55345 433 aa25■■□□□ 1.59
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CCDC40-206ENST00000572083 MRS2Q9HD23 443 aa25■■□□□ 1.59
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CCDC40-206ENST00000572083 KIF16BQ96L93 1317 aa24.92■■□□□ 1.58
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CCDC40-206ENST00000572083 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.92■■□□□ 1.58
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CCDC40-206ENST00000572083 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
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CCDC40-206ENST00000572083 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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CCDC40-206ENST00000572083 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.8■■□□□ 1.56
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