RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa36.2■■■■□ 3.39
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RAB40C-211ENST00000568586 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 FAM151AQ8WW52 585 aa36.18■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 WNK4Q96J92 1243 aa36.18■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 ABCF2Q9UG63 623 aa36.18■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 SREBF2Q12772 1141 aa36.17■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 SLF2Q8IX21 1173 aa36.17■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 HOOK2Q96ED9 719 aa36.17■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 COG6Q9Y2V7 657 aa36.17■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 MCAMP43121 646 aa36.16■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 INHBEP58166 350 aa36.16■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 PDE3AQ14432 1141 aa36.16■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
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RAB40C-211ENST00000568586 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
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RAB40C-211ENST00000568586 DBNDD2Q9BQY9 259 aa36.15■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 USP40Q9NVE5 1235 aa36.15■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 MAP3K9P80192 1104 aa36.14■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 ERICH6Q7L0X2 663 aa36.14■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF384Q8TF68 577 aa36.14■■■■□ 3.38
RAB40C-211ENST00000568586 CFHR5Q9BXR6 569 aa36.14■■■■□ 3.38
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RAB40C-211ENST00000568586 NFIAQ12857 509 aa36.13■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 IDI2Q9BXS1 227 aa36.13■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 FAM198AQ9UFP1 575 aa36.13■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa36.13■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 MYH2Q9UKX2 1941 aa36.12■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC158Q5M9N0 1113 aa36.12■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 OTOFQ9HC10 1997 aa36.11■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 GJA5P36382 358 aa36.11■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 ERC1Q8IUD2 1116 aa36.11■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 RFX7Q2KHR2 1363 aa36.11■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa36.1■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa36.1■■■■□ 3.37
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RAB40C-211ENST00000568586 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa36.1■■■■□ 3.37
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RAB40C-211ENST00000568586 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa36.09■■■■□ 3.37
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RAB40C-211ENST00000568586 IGSF3O75054 1194 aa36.08■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 ENTPD3O75355 529 aa36.08■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 TTC39AQ5SRH9 613 aa36.08■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 DCAF15Q66K64 600 aa36.08■■■■□ 3.37
RAB40C-211ENST00000568586 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
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RAB40C-211ENST00000568586 ELP3Q9H9T3 547 aa36.07■■■■□ 3.36
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RAB40C-211ENST00000568586 C20orf194Q5TEA3 1177 aa36.06■■■■□ 3.36
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RAB40C-211ENST00000568586 ZNF112Q9UJU3 913 aa36.06■■■■□ 3.36
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RAB40C-211ENST00000568586 ERO1BQ86YB8 467 aa36■■■■□ 3.35
RAB40C-211ENST00000568586 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa36■■■■□ 3.35
RAB40C-211ENST00000568586 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa35.99■■■■□ 3.35
RAB40C-211ENST00000568586 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
RAB40C-211ENST00000568586 PTPN18Q99952 460 aa35.99■■■■□ 3.35
RAB40C-211ENST00000568586 MCOLN1Q9GZU1 580 aa35.99■■■■□ 3.35
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