RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.01■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.01■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 MBD4O95243 580 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 SEC24BO95487 1268 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 DPF2Q92785 391 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 LAMB1P07942 1786 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 MYH8P13535 1937 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.99■■□□□ 1.27
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CTU2-204ENST00000564105 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 BAG3O95817 575 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 BTDP43251 543 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 LCORLQ8N3X6 602 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 ARMT1Q9H993 441 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 REC8O95072 547 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.98■■□□□ 1.27
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CTU2-204ENST00000564105 MMP14P50281 582 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 PPP4CP60510 307 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 CFAP100Q494V2 611 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.97■■□□□ 1.27
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CTU2-204ENST00000564105 SHTN1A0MZ66 631 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-204ENST00000564105 CERS3Q8IU89 383 aa22.96■■□□□ 1.27
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CTU2-204ENST00000564105 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 FSTL1Q12841 308 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 VPS53Q5VIR6 699 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 PTH1RQ03431 593 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 DLGAP5Q15398 846 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.94■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.94■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 H7C1D1 291 aa22.93■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.93■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 USP40Q9NVE5 1235 aa22.93■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 APPP05067 770 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 SPDYE6P0CI01 402 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 TEX11Q8IYF3 940 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.92■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 MAP4K1Q92918 833 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 USP26Q9BXU7 913 aa22.91■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 FOXP2O15409 715 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 EPS15P42566 896 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.9■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 USP5P45974 858 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.89■■□□□ 1.26
CTU2-204ENST00000564105 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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CTU2-204ENST00000564105 EGFRP00533 1210 aa22.89■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.89■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.89■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 MYO1BO43795 1136 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 SIPA1L1O43166 1804 aa22.87■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 FGAP02671 866 aa22.87■■□□□ 1.25
CTU2-204ENST00000564105 ALX1Q15699 326 aa22.87■■□□□ 1.25
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