RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560939.5

TLE3-223, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TLE3, Length 3,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-223	ENST00000560939	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		18.27	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	USP28	Q96RU2	1077 aa		18.27	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ARMT1	Q9H993	441 aa		18.27	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	BIN1	O00499	593 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	PDE6A	P16499	860 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	RASGRF1	Q13972	1273 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	EPC1	Q9H2F5	836 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	DISP2	A7MBM2	1401 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ADD2	P35612	726 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	NEK11	Q8NG66	645 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	AIDA	Q96BJ3	306 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ERO1A	Q96HE7	468 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	C8orf37	Q96NL8	207 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	18.26	■□□□□ 0.51	1e-6	■■■■□ 21.2
TLE3-223	ENST00000560939	NBPF3	Q9H094	633 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ABCF2	Q9UG63	623 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SMIM22	K7EJ46	135 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	IQCB1	Q15051	598 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	MICU3	Q86XE3	530 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CPLX1	O14810	134 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CCZ1B	P86790	482 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ELP1	O95163	1332 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	MBD4	O95243	580 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	PHKB	Q93100	1093 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	TMC6	Q7Z403	805 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CERS3	Q8IU89	383 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SPATA5	Q8NB90	893 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	NCOA7	Q8NI08	942 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SLIT2	O94813	1529 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ME1	P48163	572 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CAMTA2	O94983	1202 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CLCN6	P51797	869 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SDF4	Q9BRK5	362 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CAPN2	P17655	700 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	GYG1	P46976	350 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	TRDN	Q13061	729 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	LPIN2	Q92539	896 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	LAMA4	Q16363	1823 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	STX1A	Q16623	288 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	NEDD4	P46934	1319 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	ERFE	Q4G0M1	354 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	DNAI1	Q9UI46	699 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	SLC5A1	P13866	664 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TLE3-223	ENST00000560939	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TLE3-223	ENST00000560939	CHRND	Q07001	517 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TLE3-223	ENST00000560939	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TLE3-223	ENST00000560939	FSIP1	Q8NA03	581 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TLE3-223	ENST00000560939	C8orf76	Q96K31	380 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TLE3-223	ENST00000560939	IFNK	Q9P0W0	207 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TLE3-223	ENST00000560939	GYS2	P54840	703 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TLE3-223	ENST00000560939	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		18.2	■□□□□ 0.5

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