RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 INPP5BP32019 993 aa21.03■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 PRMT2P55345 433 aa21.03■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 PPATQ06203 517 aa21.03■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.03■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 SLC5A1P13866 664 aa21.02■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 FGFR2P21802 821 aa21.02■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.02■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 CPA4Q9UI42 421 aa21.02■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PRRX1-208ENST00000553786 PTPRCP08575 1304 aa21.02■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.01■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 FAM151AQ8WW52 585 aa21.01■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 PDHXO00330 501 aa21■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 TCP10Q12799 353 aa21■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 C17orf99Q6UX52 265 aa21■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 LPIN2Q92539 896 aa21■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 H0YGN5 161 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 EYA2O00167 538 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 PSMC4P43686 418 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM47Q96LD4 638 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 USP44Q9H0E7 712 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 SRRDQ9UH36 339 aa20.99■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 CTGFP29279 349 aa20.98■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.98■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 RAET1EQ8TD07 263 aa20.98■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.98■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 OSBPP22059 807 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 HOXD10P28358 340 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 PRDX5P30044 214 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 NFIAQ12857 509 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 MTFR1Q15390 333 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 SHISA4Q96DD7 197 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF521Q96K83 1311 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.97■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 GRK4P32298 578 aa20.96■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 MYPNQ86TC9 1320 aa20.96■□□□□ 0.95
PRRX1-208ENST00000553786 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.95■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.94■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 MOGSQ13724 837 aa20.94■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 ATP2B3Q16720 1220 aa20.94■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.94■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 SIL1Q9H173 461 aa20.94■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 USP40Q9NVE5 1235 aa20.94■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.94■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.93■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 DPF3Q92784 378 aa20.93■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 CYP2C8P10632 490 aa20.92■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 CCL5P13501 91 aa20.92■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 FCGRTP55899 365 aa20.92■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.92■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.92■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 E9PSI1 815 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 CXCL11O14625 94 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 UBXN2AP68543 259 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 PRKCZQ05513 592 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 RNF208Q9H0X6 261 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 PICK1Q9NRD5 415 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.91■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 CIAO1O76071 339 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 GJB1P08034 283 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 BCRP11274 1271 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 GJA8P48165 433 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 FBXO3Q9UK99 471 aa20.9■□□□□ 0.94
PRRX1-208ENST00000553786 SEMA3EO15041 775 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 PHKA1P46020 1223 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 RGS3P49796 1198 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.89■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 AK9Q5TCS8 1911 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 ENTPD3O75355 529 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.88■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PRRX1-208ENST00000553786 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms