RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 WWC1Q8IX03 1113 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 LINS1Q8NG48 757 aa8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CDH23Q9H251 3354 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MYO1BO43795 1136 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 GJB1P08034 283 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 BCRP11274 1271 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CETPP11597 493 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 GRK4P32298 578 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MMP14P50281 582 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 TCP10Q12799 353 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 PPIL2Q13356 520 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 NBPF11Q86T75 865 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ERO1BQ86YB8 467 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF208Q9H0X6 261 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ALPK3Q96L96 1907 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.65□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MYPNQ86TC9 1320 aa8.65□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.65□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.65□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 CSADQ9Y600 493 aa8.65□□□□□ -1.02
CTDSP2-208ENST00000552294 MUC3AQ02505 3323 aa8.65□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 SYN1P17600 705 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 SNAPC2Q13487 334 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 DEFB118Q96PH6 123 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 GDF15Q99988 308 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 STK31Q9BXU1 1019 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 GRM8O00222 908 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 SGPL1O95470 568 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 INHAP05111 366 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 FLT3LGP49771 235 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE4AQ14139 1066 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 RAET1EQ8TD07 263 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM196BA6NMK8 535 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 ADCY3O60266 1144 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 FGFR2P21802 821 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 PRDX5P30044 214 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 PPATQ06203 517 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 TNFAIP1Q13829 316 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 TREML2Q5T2D2 321 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 TEKT1Q969V4 418 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 JAG1P78504 1218 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 KIF22Q14807 665 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM83AQ86UY5 434 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 DEFB123Q8N688 67 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF384Q8TF68 577 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 EVI5O60447 810 aa8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 TNNI2P48788 182 aa8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM151AQ8WW52 585 aa8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.6□□□□□ -1.03
CTDSP2-208ENST00000552294 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms