RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.25■□□□□ 0.83
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CS-227ENST00000551441 PSMC4P43686 418 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 C17orf99Q6UX52 265 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 TRIM47Q96LD4 638 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 UTYO14607 1347 aa20.24■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.23■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 DCAF15Q66K64 600 aa20.23■□□□□ 0.83
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CS-227ENST00000551441 DPF3Q92784 378 aa20.23■□□□□ 0.83
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CS-227ENST00000551441 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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CS-227ENST00000551441 SRRDQ9UH36 339 aa20.21■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.21■□□□□ 0.83
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CS-227ENST00000551441 ANP32CO43423 234 aa20.2■□□□□ 0.82
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CS-227ENST00000551441 SLC5A1P13866 664 aa20.18■□□□□ 0.82
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CS-227ENST00000551441 USP40Q9NVE5 1235 aa20.18■□□□□ 0.82
CS-227ENST00000551441 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.18■□□□□ 0.82
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CS-227ENST00000551441 PRKCZQ05513 592 aa20.17■□□□□ 0.82
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CS-227ENST00000551441 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.17■□□□□ 0.82
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CS-227ENST00000551441 HOXD10P28358 340 aa20.16■□□□□ 0.82
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CS-227ENST00000551441 RNF39Q9H2S5 420 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-227ENST00000551441 MGAMO43451 1857 aa20.16■□□□□ 0.82
CS-227ENST00000551441 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-227ENST00000551441 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.15■□□□□ 0.82
CS-227ENST00000551441 LPIN2Q92539 896 aa20.15■□□□□ 0.82
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CS-227ENST00000551441 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.14■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 KIF16BQ96L93 1317 aa20.13■□□□□ 0.81
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CS-227ENST00000551441 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.13■□□□□ 0.81
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CS-227ENST00000551441 ELNP15502 786 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PHKA1P46020 1223 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 GJA8P48165 433 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 RGS3P49796 1198 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 FCGRTP55899 365 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 ATP2B3Q16720 1220 aa20.12■□□□□ 0.81
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CS-227ENST00000551441 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.12■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PTPRCP08575 1304 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 GJB1P08034 283 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 ADORA1P30542 326 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 UBXN2AP68543 259 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 DOCK2Q92608 1830 aa20.11■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.1■□□□□ 0.81
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