RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 NFIAQ12857 509 aa25.67■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.67■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 SNRKQ9NRH2 765 aa25.67■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 MECOMQ03112 1051 aa25.66■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 FAM83AQ86UY5 434 aa25.66■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.66■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.65■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.65■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.64■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.64■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.64■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.64■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 USP40Q9NVE5 1235 aa25.64■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 CA12O43570 354 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 SPRYD7Q5W111 196 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 HMMRO75330 724 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 AACSQ86V21 672 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 RNF186Q9NXI6 227 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 APBB1O00213 710 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 GJA5P36382 358 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 BTDP43251 543 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 TCP10Q12799 353 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 FAM151AQ8WW52 585 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 ZAP70P43403 619 aa25.6■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 WNK4Q96J92 1243 aa25.6■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 RAI14Q9P0K7 980 aa25.6■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.6■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 OTOFQ9HC10 1997 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 UNCXA6NJT0 531 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 RHBDL3P58872 404 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 TNS4Q8IZW8 715 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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CS-222ENST00000550996 SLF2Q8IX21 1173 aa25.58■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.58■■□□□ 1.69
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CS-222ENST00000550996 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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CS-222ENST00000550996 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.58■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.58■■□□□ 1.69
CS-222ENST00000550996 TM4SF4P48230 202 aa25.57■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 RGS3P49796 1198 aa25.57■■□□□ 1.68
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CS-222ENST00000550996 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.57■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 ELP3Q9H9T3 547 aa25.57■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 MAP3K9P80192 1104 aa25.56■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 IFFO2Q5TF58 517 aa25.56■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.56■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.56■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.56■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 RAB11FIP3O75154 756 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 GSTO1P78417 241 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 WRNIP1Q96S55 665 aa25.54■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 ENTPD3O75355 529 aa25.53■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 OPTNQ96CV9 577 aa25.53■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.53■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.53■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 LDHCP07864 332 aa25.52■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 SLURP2P0DP57 97 aa25.52■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 PICALMQ13492 652 aa25.52■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 BCL11AQ9H165 835 aa25.52■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.52■■□□□ 1.68
CS-222ENST00000550996 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 INPP5BP32019 993 aa25.51■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 SREBF2Q12772 1141 aa25.51■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 DCAF15Q66K64 600 aa25.51■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 HOOK2Q96ED9 719 aa25.51■■□□□ 1.67
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CS-222ENST00000550996 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
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