RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 TIMM10P62072 90 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 TFCP2Q12800 502 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 AAMPQ13685 434 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 RASA3Q14644 834 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 MXD3Q9BW11 206 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCF2Q9UG63 623 aa6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC10A3P09131 477 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 POLA2Q14181 598 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA5Q8NB90 893 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 RAI14Q9P0K7 980 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 PSME4Q14997 1843 aa6.85□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-215ENST00000544584 USP40Q9NVE5 1235 aa6.84□□□□□ -1.31
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CLSTN3-215ENST00000544584 GTF2A2P52657 109 aa6.83□□□□□ -1.32
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CLSTN3-215ENST00000544584 CEP85Q6P2H3 762 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 PANK1Q8TE04 598 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM151AQ8WW52 585 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.83□□□□□ -1.32
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CLSTN3-215ENST00000544584 COG6Q9Y2V7 657 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 COL4A1P02462 1669 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 HLA-DOAP06340 250 aa6.82□□□□□ -1.32
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CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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CLSTN3-215ENST00000544584 ERO1BQ86YB8 467 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 IDI2Q9BXS1 227 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 34.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 PRO3102Q9H379 93 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 PICK1Q9NRD5 415 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 H0YGN5 161 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR25O00155 361 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 CETPP11597 493 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 ADORA1P30542 326 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 BTDP43251 543 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-215ENST00000544584 MECOMQ03112 1051 aa6.81□□□□□ -1.32
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