RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.01■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 CPA4Q9UI42 421 aa26■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC5A1P13866 664 aa25.99■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 INPP5BP32019 993 aa25.99■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 TCP10Q12799 353 aa25.99■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.99■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 CEP290O15078 2479 aa25.98■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 MGAMO43451 1857 aa25.98■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 KIF16BQ96L93 1317 aa25.98■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 GNRH1P01148 92 aa25.98■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 PPATQ06203 517 aa25.98■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 PTPRCP08575 1304 aa25.97■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 PRMT2P55345 433 aa25.97■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.97■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 PDHXO00330 501 aa25.96■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 PSMC4P43686 418 aa25.96■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 RAET1EQ8TD07 263 aa25.96■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 MRIQ9BWK5 157 aa25.96■■□□□ 1.75
RHBDD1-215ENST00000539613 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.95■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 H0YGN5 161 aa25.95■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 FGFR2P21802 821 aa25.95■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.95■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.95■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.94■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM151AQ8WW52 585 aa25.94■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 TRIM47Q96LD4 638 aa25.94■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 MYPNQ86TC9 1320 aa25.93■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 EYA2O00167 538 aa25.93■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 MTFR1Q15390 333 aa25.93■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 C17orf99Q6UX52 265 aa25.93■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 LPIN2Q92539 896 aa25.93■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 SRRDQ9UH36 339 aa25.93■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.92■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 OSBPP22059 807 aa25.92■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 HOXD10P28358 340 aa25.92■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 PRDX5P30044 214 aa25.92■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 NFIAQ12857 509 aa25.92■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.92■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 SIL1Q9H173 461 aa25.92■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 CTGFP29279 349 aa25.91■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 GRK4P32298 578 aa25.91■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 SHISA4Q96DD7 197 aa25.91■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 USP44Q9H0E7 712 aa25.91■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 DOCK1Q14185 1865 aa25.91■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 DPF3Q92784 378 aa25.9■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.9■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 PTPRFP10586 1907 aa25.9■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.89■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 ATP2B3Q16720 1220 aa25.89■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.89■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 USP40Q9NVE5 1235 aa25.89■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
RHBDD1-215ENST00000539613 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.88■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.88■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 FCGRTP55899 365 aa25.87■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.87■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.87■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF521Q96K83 1311 aa25.87■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 CYP2C8P10632 490 aa25.86■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 CCL5P13501 91 aa25.86■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 PRKCZQ05513 592 aa25.86■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 RNF208Q9H0X6 261 aa25.86■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 PICK1Q9NRD5 415 aa25.86■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 UBXN2AP68543 259 aa25.85■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 MOGSQ13724 837 aa25.85■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.85■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.85■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.84■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.84■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 PHKA1P46020 1223 aa25.83■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 RGS3P49796 1198 aa25.83■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.83■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.83■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.83■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.83■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.83■■□□□ 1.73
RHBDD1-215ENST00000539613 E9PSI1 815 aa25.82■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 GJB1P08034 283 aa25.82■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 GJA8P48165 433 aa25.82■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.82■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.82■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 CXCL11O14625 94 aa25.81■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 BCRP11274 1271 aa25.81■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.81■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RHBDD1-215ENST00000539613 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms