RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539490.1

DYRK4-208, Transcript of dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4, human

TSL 2

Gene DYRK4, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYRK4-208	ENST00000539490	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	HUNK	P57058	714 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	IFT57	Q9NWB7	429 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	RTL9	Q8NET4	1388 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	MYH3	P11055	1940 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CA12	O43570	354 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	UFL1	O94874	794 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	MSS51	Q4VC12	460 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	TSPYL6	Q8N831	410 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	PSME4	Q14997	1843 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	ADM5	C9JUS6	153 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	USP17L8	P0C7I0	530 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	NOG	Q13253	232 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	RGMB	Q6NW40	437 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	CACNA1F	O60840	1977 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	SPEF2	Q9C093	1822 aa		7.52	□□□□□ -1.2
DYRK4-208	ENST00000539490	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	IGKV5-2	P06315	115 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	JUND	P17535	347 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ATP2B4	P23634	1241 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	SCARF1	Q14162	830 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	DESI1	Q6ICB0	168 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	KSR2	Q6VAB6	950 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	BANK1	Q8NDB2	785 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	GGA3	Q9NZ52	723 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	XDH	P47989	1333 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	S1PR4	O95977	384 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	RGS19	P49795	217 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	FLII	Q13045	1269 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	GML	Q99445	158 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	TRPA1	O75762	1119 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CTSW	P56202	376 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MCM6	Q14566	821 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC184	Q52MB2	194 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	G2E3	Q7L622	706 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CDCA5	Q96FF9	252 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	STK31	Q9BXU1	1019 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	GREM2	Q9H772	168 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	SNRK	Q9NRH2	765 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	RNF186	Q9NXI6	227 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490		H7C1W4	665 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21

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