RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534404.1

LRP4-205, Transcript of LDL receptor related protein 4, human

TSL 5

Gene LRP4, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP4-205	ENST00000534404	RNF186	Q9NXI6	227 aa		40.61	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		40.61	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	UNCX	A6NJT0	531 aa		40.6	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		40.6	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		40.6	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		40.6	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	USP40	Q9NVE5	1235 aa		40.6	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	PI16	Q6UXB8	463 aa		40.59	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		40.59	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	SPRYD7	Q5W111	196 aa		40.58	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		40.58	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		40.58	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		40.57	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	HOOK2	Q96ED9	719 aa		40.57	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	MCAM	P43121	646 aa		40.56	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	SREBF2	Q12772	1141 aa		40.56	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	PDE3A	Q14432	1141 aa		40.56	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	HMMR	O75330	724 aa		40.55	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	TCP10	Q12799	353 aa		40.55	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		40.55	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		40.55	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		40.55	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	MECOM	Q03112	1051 aa		40.54	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		40.54	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	FAM151A	Q8WW52	585 aa		40.54	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	RAI14	Q9P0K7	980 aa		40.54	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	WNK4	Q96J92	1243 aa		40.53	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		40.52	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	TM4SF4	P48230	202 aa		40.52	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	SNRK	Q9NRH2	765 aa		40.52	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		40.52	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	GAK	O14976	1311 aa		40.51	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	GSTO1	P78417	241 aa		40.51	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	ELP3	Q9H9T3	547 aa		40.51	■■■■■ 4.08
LRP4-205	ENST00000534404	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		40.5	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	MAP3K9	P80192	1104 aa		40.5	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	NFIA	Q12857	509 aa		40.5	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	DCAF15	Q66K64	600 aa		40.5	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	CSAD	Q9Y600	493 aa		40.5	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	LDHC	P07864	332 aa		40.49	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	BTD	P43251	543 aa		40.49	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	CAPN15	O75808	1086 aa		40.48	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	APBB1	O00213	710 aa		40.47	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	40.47	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		40.47	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	INHBE	P58166	350 aa		40.46	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		40.46	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	AACS	Q86V21	672 aa		40.46	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	OPTN	Q96CV9	577 aa		40.46	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	VGLL4	Q14135	290 aa		40.45	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		40.45	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	WRNIP1	Q96S55	665 aa		40.45	■■■■■ 4.07
LRP4-205	ENST00000534404	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		40.44	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		40.44	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	OTOF	Q9HC10	1997 aa		40.43	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	TBC1D8	O95759	1140 aa		40.43	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	RGS3	P49796	1198 aa		40.43	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	IDI2	Q9BXS1	227 aa		40.43	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		40.43	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	BCL11A	Q9H165	835 aa		40.43	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		40.42	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF384	Q8TF68	577 aa		40.42	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		40.42	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	ENTPD3	O75355	529 aa		40.41	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	GJA5	P36382	358 aa		40.41	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	ZAP70	P43403	619 aa		40.41	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	PICALM	Q13492	652 aa		40.41	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	40.41	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	AK9	Q5TCS8	1911 aa		40.4	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		40.4	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		40.39	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	ALDH1A1	P00352	501 aa		40.39	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
LRP4-205	ENST00000534404	IFNL1	Q8IU54	200 aa		40.38	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	RAB11FIP3	O75154	756 aa		40.37	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		40.37	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	OTUD5	Q96G74	571 aa		40.37	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		40.36	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	RHBDL3	P58872	404 aa		40.35	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	DGKZ	Q13574	1117 aa		40.34	■■■■■ 4.05

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