RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533259.1

PDE4DIP-231, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCL15	Q16663	113 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LPIN2	Q92539	896 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IRF6	O14896	467 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NEFL	P07196	543 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC5A1	P13866	664 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MAST3	O60307	1309 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TLR2	O60603	784 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CIAO1	O76071	339 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CETP	P11597	493 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	INPP5B	P32019	993 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NFIA	Q12857	509 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PPIL2	Q13356	520 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MEIS3	Q99687	375 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SIL1	Q9H173	461 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZBTB22	O15209	634 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GNAI3	P08754	354 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PRDX5	P30044	214 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PPAT	Q06203	517 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CEP290	O15078	2479 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PHKA1	P46020	1223 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TCP10	Q12799	353 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MOGS	Q13724	837 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GNAI2	P04899	355 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CTGF	P29279	349 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ADORA1	P30542	326 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TIMM10	P62072	90 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SEMA3E	O15041	775 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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