RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 USP40Q9NVE5 1235 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 CACNB3P54284 484 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 GRM1Q13255 1194 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 RGMBQ6NW40 437 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 FAM83AQ86UY5 434 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 AK9Q5TCS8 1911 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 DOCK2Q92608 1830 aa26.76■■□□□ 1.88
PTPRK-222ENST00000532751 BTDP43251 543 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 PRKG1Q13976 671 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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PTPRK-222ENST00000532751 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 MOB2Q70IA6 237 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF384Q8TF68 577 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC102AQ96A19 550 aa26.74■■□□□ 1.87
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PTPRK-222ENST00000532751 HOOK2Q96ED9 719 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 GPATCH3Q96I76 525 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 TEPSINQ96N21 525 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.73■■□□□ 1.87
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PTPRK-222ENST00000532751 ATP5JP18859 108 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K12Q12852 859 aa26.72■■□□□ 1.87
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PTPRK-222ENST00000532751 IDI2Q9BXS1 227 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRK-222ENST00000532751 MAP2K2P36507 400 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 TCP10Q12799 353 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 NFIAQ12857 509 aa26.7■■□□□ 1.86
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PTPRK-222ENST00000532751 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.7■■□□□ 1.86
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PTPRK-222ENST00000532751 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.68■■□□□ 1.86
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PTPRK-222ENST00000532751 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 DCAF15Q66K64 600 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 HAUS7Q99871 368 aa26.67■■□□□ 1.86
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PTPRK-222ENST00000532751 PICALMQ13492 652 aa26.66■■□□□ 1.86
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PTPRK-222ENST00000532751 CERS3Q8IU89 383 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 TEX11Q8IYF3 940 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.65■■□□□ 1.86
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PTPRK-222ENST00000532751 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 AIDAQ96BJ3 306 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRK-222ENST00000532751 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.64■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 FOCADQ5VW36 1801 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 BEGAINQ9BUH8 593 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRK-222ENST00000532751 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
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