RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531500.5

RBM25-209, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 3

Gene RBM25, Length 1,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-209	ENST00000531500	GOLIM4	O00461	696 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	BAG3	O95817	575 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ERC2	O15083	957 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	CYP7A1	P22680	504 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	HAUS7	Q99871	368 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	MX1	P20591	662 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	HUNK	P57058	714 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	FKBP1B	P68106	108 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	TCP10	Q12799	353 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	PRKG1	Q13976	671 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	NEFL	P07196	543 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	PLCG2	P16885	1265 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	GRM1	Q13255	1194 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25	2e-7	■■□□□ 12.3
RBM25-209	ENST00000531500	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ECE1	P42892	770 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	NFIA	Q12857	509 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	PICALM	Q13492	652 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	ENTPD3	O75355	529 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	RGS3	P49796	1198 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	RHBDL3	P58872	404 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	PPP4C	P60510	307 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	NUCB1	Q02818	461 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	PDE6A	P16499	860 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	VEGFB	P49765	207 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	PDE1A	P54750	535 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	ADD2	P35612	726 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM25-209	ENST00000531500	USP5	P45974	858 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms