RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521401.1

HOXA3-204, Transcript of homeobox A3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA3, Length 598 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-204ENST00000521401 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 SREBF2Q12772 1141 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 GORABQ5T7V8 394 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 MCAMP43121 646 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 MAP3K9P80192 1104 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 SPATA5Q8NB90 893 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 ZNF384Q8TF68 577 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 FAM151AQ8WW52 585 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 USP40Q9NVE5 1235 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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HOXA3-204ENST00000521401 TBC1D8O95759 1140 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 ABHD8Q96I13 439 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 ELP3Q9H9T3 547 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 MECOMQ03112 1051 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 TCP10Q12799 353 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 VGLL4Q14135 290 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA3-204ENST00000521401 INHBEP58166 350 aa26.51■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 OPTNQ96CV9 577 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 IFNL1Q8IU54 200 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 SLF2Q8IX21 1173 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 IDI2Q9BXS1 227 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 HOOK2Q96ED9 719 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.49■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 RHBDL3P58872 404 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 DGKZQ13574 1117 aa26.48■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 DCAF15Q66K64 600 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 WRNIP1Q96S55 665 aa26.48■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 PTPN18Q99952 460 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXA3-204ENST00000521401 SNRKQ9NRH2 765 aa26.47■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 GPR25O00155 361 aa26.46■■□□□ 1.83
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HOXA3-204ENST00000521401 GSTO1P78417 241 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXA3-204ENST00000521401 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXA3-204ENST00000521401 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXA3-204ENST00000521401 OTUD5Q96G74 571 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXA3-204ENST00000521401 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXA3-204ENST00000521401 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXA3-204ENST00000521401 ERO1BQ86YB8 467 aa26.42■■□□□ 1.82
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