RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516877.1

RNU6-1234P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1234, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1234P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GDNFP39905 211 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NXPE3Q969Y0 559 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ELP3Q9H9T3 547 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LGR6Q9HBX8 967 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KANSL3Q9P2N6 904 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PLAGL2Q9UPG8 496 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LGR5O75473 907 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CES1P23141 567 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CDK5R2Q13319 367 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 POU4F3Q15319 338 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 WDR26Q9H7D7 661 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PIDD1Q9HB75 910 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MAOBP27338 520 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZAP70P43403 619 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NEUROD2Q15784 382 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF385BQ569K4 471 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF438Q7Z4V0 828 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ANKMY2Q8IV38 441 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NRSN2Q9GZP1 204 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RFXAPO00287 272 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 INSRRP14616 1297 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAC2P15153 192 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ITIH2P19823 946 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PTK7Q13308 1070 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C16orf46Q6P387 395 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ASAP3Q8TDY4 903 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 UCN2Q96RP3 112 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OSMRQ99650 979 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CORO1BQ9BR76 489 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DUSP23Q9BVJ7 150 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SRRDQ9UH36 339 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM196BA6NMK8 535 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 AOC2O75106 756 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TRPA1O75762 1119 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ACPPP15309 386 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CLCN7P51798 805 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ABHD4Q8TB40 342 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GPR152Q8TDT2 470 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HHIPQ96QV1 700 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM63CQ9P1W3 806 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CNTN3Q9P232 1028 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EFEMP1Q12805 493 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 XKR5Q6UX68 686 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NPAS4Q8IUM7 802 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GPR20Q99678 358 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ATXN3LQ9H3M9 355 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 COG6Q9Y2V7 657 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 U3KQE9 123 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L15C9J2P7 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L10C9JJH3 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L13C9JLJ4 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L12C9JPN9 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L11C9JVI0 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L21D6R901 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L18D6R9N7 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L22D6RA61 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L17D6RBQ6 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L19D6RCP7 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L20D6RJB6 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TRIM13O60858 407 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SEMA7AO75326 666 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EDN3P14138 238 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 USP17L24Q0WX57 530 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ABTB2Q8N961 1025 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C1orf127Q8N9H9 656 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TTC16Q8NEE8 873 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KCNK12Q9HB15 430 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PALD1Q9ULE6 856 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LEFTY1O75610 366 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLFN14P0C7P3 912 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DLG4P78352 724 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PDE3AQ14432 1141 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TEPSINQ96N21 525 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GNAT3A8MTJ3 354 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CTSBP07858 339 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PCSK2P16519 638 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZXDAP98168 799 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PLP2Q04941 152 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121 ms