RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 GPATCH3Q96I76 525 aa21.81■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 ATP5JP18859 108 aa21.8■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 BTDP43251 543 aa21.8■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 VEGFBP49765 207 aa21.8■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.8■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 FAM83AQ86UY5 434 aa21.8■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.79■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K12Q12852 859 aa21.79■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.79■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 GRM1Q13255 1194 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF384Q8TF68 577 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 CAPNS2Q96L46 248 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 BAG3O95817 575 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 PRKG1Q13976 671 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 RGMBQ6NW40 437 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 HOOK2Q96ED9 719 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-215ENST00000514625 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 GOLIM4O00461 696 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 JMYQ8N9B5 988 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 FAM151AQ8WW52 585 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC102AQ96A19 550 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 PLCG2P16885 1265 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 TCP10Q12799 353 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 MOB2Q70IA6 237 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 TEPSINQ96N21 525 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 HAUS7Q99871 368 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 IDI2Q9BXS1 227 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 ENTPD3O75355 529 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 CYP7A1P22680 504 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 NFIAQ12857 509 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 RGS3P49796 1198 aa21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 ERC2O15083 957 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 RHBDL3P58872 404 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 PPP4CP60510 307 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 PICALMQ13492 652 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K11Q16584 847 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 DCAF15Q66K64 600 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 CERS3Q8IU89 383 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.72■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 UNCXA6NJT0 531 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 IGHDP01880 384 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 MAP2K2P36507 400 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 NOGQ13253 232 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 SMC5Q8IY18 1101 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 TEX11Q8IYF3 940 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 FZD1Q9UP38 647 aa21.71■■□□□ 1.07
FAAP20-215ENST00000514625 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.7■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.7■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 AOC2O75106 756 aa21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 SLC10A3P09131 477 aa21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 PDE6AP16499 860 aa21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 MX1P20591 662 aa21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.69■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.68■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.68■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.68■■□□□ 1.06
FAAP20-215ENST00000514625 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms