RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	KANK3	Q6NY19	840 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	TREH	O43280	583 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	SIK1	P57059	783 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	CHSY3	Q70JA7	882 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM35A	Q86V20	835 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	PPL	O60437	1756 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	KIF4A	O95239	1232 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	AMPD1	P23109	780 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	DSC3	Q14574	896 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PDE4D-222	ENST00000514552	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	TECPR2	O15040	1411 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	CPB1	P15086	417 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	EREG	O14944	169 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	GHRH	P01286	108 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ERCC3	P19447	782 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ORC1	Q13415	861 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	PERM1	Q5SV97	790 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	SPACA7	Q96KW9	195 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	RBSN	Q9H1K0	784 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	IFT172	Q9UG01	1749 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552		J3QW42	95 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP120	Q8N960	986 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC9	Q92623	222 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	CSRNP1	Q96S65	589 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ALB	P02768	609 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	EDN3	P14138	238 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	COL19A1	Q14993	1142 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552		M0R082	166 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	RXRB	P28702	533 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	DGKG	P49619	791 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	PLD4	Q96BZ4	506 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	AFF2	P51816	1311 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	EP400	Q96L91	3159 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PDE4D-222	ENST00000514552	PIK3C2G	O75747	1445 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	LILRB5	O75023	590 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	MYOM2	P54296	1465 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCC11	Q96J66	1382 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	RGS12	O14924	1447 aa		10	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	KIF1A	Q12756	1690 aa		10	□□□□□ -0.81
PDE4D-222	ENST00000514552	PXDN	Q92626	1479 aa		10	□□□□□ -0.81

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