RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 ATP11AP98196 1134 aa3.09□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 C16orf86Q6ZW13 317 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-218ENST00000509368 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
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PDE4D-218ENST00000509368 CHMP4BP1P59074 171 aa3.08□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 MDFIQ99750 246 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 EHD4Q9H223 541 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PP55 124 aa3.08□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 SOX18P35713 384 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 ETFBP38117 255 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 CCINQ13939 588 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.924e-6■■□□□ 13.4
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PDE4D-218ENST00000509368 FIGNL1Q6PIW4 674 aa3.08□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 NUDT8Q8WV74 236 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 SALL4Q9UJQ4 1053 aa3.08□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.07□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 PRR12Q9ULL5 1215 aa3.07□□□□□ -1.92
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PDE4D-218ENST00000509368 S100BP04271 92 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 PDGFRBP09619 1106 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 CDC25BP30305 580 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 APOBRQ0VD83 1088 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 SNAP47Q5SQN1 464 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 HGSNATQ68CP4 663 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-218ENST00000509368 DTHD1Q6ZMT9 781 aa3.06□□□□□ -1.92
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