RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 OPTNQ96CV9 577 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP40Q9NVE5 1235 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RLBP1P12271 317 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP8B2P98198 1209 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCP10Q12799 353 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VGLL4Q14135 290 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM151AQ8WW52 585 aa28.79■■■□□ 2.2
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCAF15Q66K64 600 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AK9Q5TCS8 1911 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLA2Q14181 598 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLF2Q8IX21 1173 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WRNIP1Q96S55 665 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FKTNO75072 461 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIGA2Q7L4E1 593 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSH3Q8TE77 659 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFIAQ12857 509 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OTUD5Q96G74 571 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAMB1P07942 1786 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA5Q8NB90 893 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GTF2A2P52657 109 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PANK1Q8TE04 598 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPN18Q99952 460 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAKO14976 1311 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PI16Q6UXB8 463 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERO1BQ86YB8 467 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa28.7■■■□□ 2.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNNI3KQ59H18 835 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR108Q9NPR9 543 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MS4A1P11836 297 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTDP43251 543 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGS3P49796 1198 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRHR2Q13324 411 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.69■■■□□ 2.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRI3BPQ8WY22 251 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IDI2Q9BXS1 227 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAI14Q9P0K7 980 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ENTPD3O75355 529 aa28.67■■■□□ 2.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 INPP5BP32019 993 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCAMP43121 646 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GSTO1P78417 241 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRP2BPQ9P2M1 347 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CETPP11597 493 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PICALMQ13492 652 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP85Q6P2H3 762 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNRKQ9NRH2 765 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF112Q9UJU3 913 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IRF6O14896 467 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPIL2Q13356 520 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNAPC2Q13487 334 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF384Q8TF68 577 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGS19P49795 217 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPATQ06203 517 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
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