RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 H0YGN5 161 aa9.77□□□□□ -0.84
PDE4D-210ENST00000503258 GRK4P32298 578 aa9.77□□□□□ -0.84
PDE4D-210ENST00000503258 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.77□□□□□ -0.84
PDE4D-210ENST00000503258 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 KLRK1P26718 216 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 GDF15Q99988 308 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 CAP1Q01518 475 aa9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 CCL5P13501 91 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 OSBPP22059 807 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 SLF2Q8IX21 1173 aa9.76□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 IRF6O14896 467 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 CERS3Q8IU89 383 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 TSPYL6Q8N831 410 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF521Q96K83 1311 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.73□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 PDHXO00330 501 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 COL6A1P12109 1028 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 G2E3Q7L622 706 aa9.73□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 CTGFP29279 349 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.72□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 AOX1Q06278 1338 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 RLFQ13129 1914 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 PSMC4P43686 418 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 HMGCRP04035 888 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 RAET1EQ8TD07 263 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 VEZTQ9HBM0 779 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-210ENST00000503258 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.71□□□□□ -0.85
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PDE4D-210ENST00000503258 SLC5A1P13866 664 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 WRNIP1Q96S55 665 aa9.71□□□□□ -0.86
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PDE4D-210ENST00000503258 CLRN2A0PK11 232 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 C12orf42Q96LP6 360 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 PARP14Q460N5 1801 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 PTPRAP18433 802 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 MTX1Q13505 466 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PDE4D-210ENST00000503258 GJD2Q9UKL4 321 aa9.69□□□□□ -0.86
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