RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PANK1Q8TE04 598 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SSH3Q8TE77 659 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CSADQ9Y600 493 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ALDH1A1P00352 501 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GJA5P36382 358 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TCP10Q12799 353 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM151AQ8WW52 585 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OPTNQ96CV9 577 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IFNL1Q8IU54 200 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLF2Q8IX21 1173 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR25O00155 361 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MS4A1P11836 297 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VGLL4Q14135 290 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DCAF15Q66K64 600 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NFIAQ12857 509 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPATA5Q8NB90 893 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WRNIP1Q96S55 665 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR108Q9NPR9 543 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNNI3KQ59H18 835 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PI16Q6UXB8 463 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FKTNO75072 461 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MECOMQ03112 1051 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OTUD5Q96G74 571 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GAKO14976 1311 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CEP85Q6P2H3 762 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAI14Q9P0K7 980 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LDHCP07864 332 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MCAMP43121 646 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BTDP43251 543 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGS3P49796 1198 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GTF2A2P52657 109 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GSTO1P78417 241 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTPN18Q99952 460 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERO1BQ86YB8 467 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IDI2Q9BXS1 227 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNRKQ9NRH2 765 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ENTPD3O75355 529 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCL15Q16663 113 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INPP5BP32019 993 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PICALMQ13492 652 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COG6Q9Y2V7 657 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OTOFQ9HC10 1997 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CRHR2Q13324 411 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF384Q8TF68 577 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AK9Q5TCS8 1911 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IRF6O14896 467 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CETPP11597 493 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPATQ06203 517 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPIL2Q13356 520 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNAPC2Q13487 334 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms