RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 A0A1B0GUL7 405 aa22.91■■□□□ 1.26
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CHD1L-209ENST00000492728 CRHR2Q13324 411 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.91■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 SEMA3EO15041 775 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 ZBTB22O15209 634 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 CAP1Q01518 475 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 OTUD5Q96G74 571 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 XAGE2Q96GT9 111 aa22.9■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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CHD1L-209ENST00000492728 WRNIP1Q96S55 665 aa22.89■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.89■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.89■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.88■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 TCP10Q12799 353 aa22.88■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.88■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.88■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 CSADQ9Y600 493 aa22.88■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 GAKO14976 1311 aa22.87■■□□□ 1.25
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CHD1L-209ENST00000492728 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.87■■□□□ 1.25
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CHD1L-209ENST00000492728 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.86■■□□□ 1.25
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CHD1L-209ENST00000492728 INPP5BP32019 993 aa22.86■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 CCL15Q16663 113 aa22.86■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 PI16Q6UXB8 463 aa22.86■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.86■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF384Q8TF68 577 aa22.86■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 USP40Q9NVE5 1235 aa22.86■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.86■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.85■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.84■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 GTF2A2P52657 109 aa22.84■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.84■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.84■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 ABCF2Q9UG63 623 aa22.84■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.84■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 IRF6O14896 467 aa22.83■■□□□ 1.25
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CHD1L-209ENST00000492728 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.83■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.83■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 ERO1BQ86YB8 467 aa22.83■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.83■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.83■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.83■■□□□ 1.25
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.83■■□□□ 1.25
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CHD1L-209ENST00000492728 CENPFP49454 3210 aa22.82■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 DOCK2Q92608 1830 aa22.81■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 RGS3P49796 1198 aa22.81■■□□□ 1.24
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CHD1L-209ENST00000492728 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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CHD1L-209ENST00000492728 IDI2Q9BXS1 227 aa22.81■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.81■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.81■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 BTBD19C9JJ37 291 aa22.8■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 MECOMQ03112 1051 aa22.8■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.8■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 BRCA2P51587 3418 aa22.8■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 MCAMP43121 646 aa22.79■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 BTDP43251 543 aa22.79■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 RHBDL3P58872 404 aa22.79■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 SSH3Q8TE77 659 aa22.79■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.79■■□□□ 1.24
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CHD1L-209ENST00000492728 SPATA5Q8NB90 893 aa22.78■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 ERO1AQ96HE7 468 aa22.78■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 ENTPD3O75355 529 aa22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 CETPP11597 493 aa22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 ATP8B2P98198 1209 aa22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 PPATQ06203 517 aa22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 SNAPC2Q13487 334 aa22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CHD1L-209ENST00000492728 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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