RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 ARID3AQ99856 593 aa8.17□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.17□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 FYB1O15117 783 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 KCNQ2O43526 872 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 CHD4Q14839 1912 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 TBCELQ5QJ74 424 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 TNS4Q8IZW8 715 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 TMC1Q8TDI8 760 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 IP6K1Q92551 441 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 EML1O00423 815 aa8.15□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 HOXC9P31274 260 aa8.15□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 SYT9Q86SS6 491 aa8.15□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 TRIM11Q96F44 468 aa8.15□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.15□□□□□ -1.1
JMJD1C-208ENST00000490669 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 IL2RBP14784 551 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 TRIM50Q86XT4 487 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ELOA3Q8NG57 546 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 PLVAPQ9BX97 442 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 INSRP06213 1382 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 C4BP0C0L5 1744 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SERTM1A2A2V5 107 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 RAD21O60216 631 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ALAS2P22557 587 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.13□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 C4AP0C0L4 1744 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 EXOC5O00471 708 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 CLSTN1O94985 981 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 TXNRD1Q16881 649 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 FLT4P35916 1363 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 USP17L3A6NCW0 530 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 USP17L4A6NCW7 530 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 POM121CA8CG34 1229 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SIN3BO75182 1162 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ATP1A2P50993 1020 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 TMF1P82094 1093 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF827Q17R98 1081 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC102BQ68D86 513 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 COG3Q96JB2 828 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 NBPF4Q96M43 638 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 MDFIQ99750 246 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 TJP1Q07157 1748 aa8.11□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 CLDN10P78369 228 aa8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC30A3Q99726 388 aa8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 UTRNP46939 3433 aa8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.09□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.09□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 DOC2BQ14184 412 aa8.09□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC15A2Q16348 729 aa8.09□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.09□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.09□□□□□ -1.11
JMJD1C-208ENST00000490669 MAP3K5Q99683 1374 aa8.09□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 GATA4P43694 442 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 SPEM2Q0P670 501 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 Q8N3U1 123 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms