RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
EHD1-211ENST00000489379 GSTO1P78417 241 aa29.84■■■□□ 2.37
EHD1-211ENST00000489379 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
EHD1-211ENST00000489379 GAKO14976 1311 aa29.84■■■□□ 2.37
EHD1-211ENST00000489379 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
EHD1-211ENST00000489379 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.83■■■□□ 2.37
EHD1-211ENST00000489379 TEPSINQ96N21 525 aa29.83■■■□□ 2.37
EHD1-211ENST00000489379 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
EHD1-211ENST00000489379 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.82■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 FOXN1O15353 648 aa29.82■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 PRKG1Q13976 671 aa29.82■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.82■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 AACSQ86V21 672 aa29.82■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.81■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 AK9Q5TCS8 1911 aa29.81■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 MECOMQ03112 1051 aa29.8■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 PI16Q6UXB8 463 aa29.8■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 FAM151AQ8WW52 585 aa29.8■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 USP40Q9NVE5 1235 aa29.8■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.8■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa29.79■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 CACNB3P54284 484 aa29.79■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 RAI14Q9P0K7 980 aa29.79■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.78■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.78■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.78■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.78■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.77■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 IDI2Q9BXS1 227 aa29.77■■■□□ 2.36
EHD1-211ENST00000489379 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.76■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 ZIC5Q96T25 663 aa29.76■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 SNRKQ9NRH2 765 aa29.76■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.75■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 DCAF15Q66K64 600 aa29.75■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 APBB1O00213 710 aa29.74■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 ENTPD3O75355 529 aa29.74■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 BTDP43251 543 aa29.74■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 ZAP70P43403 619 aa29.74■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 ZNF384Q8TF68 577 aa29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 CSRNP1Q96S65 589 aa29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 FZD1Q9UP38 647 aa29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 NPM3O75607 178 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 SPRYD7Q5W111 196 aa29.72■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.72■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 OTOFQ9HC10 1997 aa29.72■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 MAP3K9P80192 1104 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 NFIAQ12857 509 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 AAMPQ13685 434 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 DCTPP1Q9H773 170 aa29.71■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 LAMB1P07942 1786 aa29.7■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 BAG3O95817 575 aa29.7■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 LBX1P52954 281 aa29.7■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 SREBF2Q12772 1141 aa29.7■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 TCP10Q12799 353 aa29.7■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.35
EHD1-211ENST00000489379 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.69■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 PLCG2P16885 1265 aa29.69■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 TM4SF4P48230 202 aa29.69■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 RGS3P49796 1198 aa29.69■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 INHBEP58166 350 aa29.69■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.69■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 CSADQ9Y600 493 aa29.69■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 RHBDL3P58872 404 aa29.68■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 WNK4Q96J92 1243 aa29.68■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.68■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 DOCK2Q92608 1830 aa29.68■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 CERS3Q8IU89 383 aa29.67■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 PPP4CP60510 307 aa29.66■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 MAP3K12Q12852 859 aa29.66■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 CRBNQ96SW2 442 aa29.65■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 RNF186Q9NXI6 227 aa29.65■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 IDH1O75874 414 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 WRNIP1Q96S55 665 aa29.64■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.64■■■□□ 2.34
EHD1-211ENST00000489379 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 VGLL4Q14135 290 aa29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms