RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA8P51970 172 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 FAM53CQ9NYF3 392 aa18.62■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 ACTN2P35609 894 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 IL15P40933 162 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 SCARF1Q14162 830 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 RGS22Q8NE09 1264 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 KCNB2Q92953 911 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 PTPDC1A2A3K4 754 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 M0R2C6 588 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 KRT32Q14532 448 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 WDR24Q96S15 920 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.61■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 MICALL1Q8N3F8 863 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 ADKP55263 362 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 BTG4Q9NY30 223 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.6■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 SNAP23O00161 211 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 HLFQ16534 295 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 H3BQF6 201 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA1Q92805 767 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 OSBP2Q969R2 916 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 XAGE2Q96GT9 111 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1468Q9P260 1216 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 ZAP70P43403 619 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 METTL24Q5JXM2 366 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 MAST3O60307 1309 aa18.59■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 DPF2Q92785 391 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 DHX58Q96C10 678 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 CNNM1Q9NRU3 951 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.58■□□□□ 0.57
CCSAP-204ENST00000483092 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 PIGBQ92521 554 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM232C9JQI7 657 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 E7EWF7 191 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa18.58■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 RXRAP19793 462 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC93Q567U6 631 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 OLFM4Q6UX06 510 aa18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CPLX1O14810 134 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 IVLP07476 585 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 RCOR1Q9UKL0 485 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 MNAT1P51948 309 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 TCIRG1Q13488 830 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC4Q96A65 974 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 GREM2Q9H772 168 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP4BP1P59074 171 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CTR9Q6PD62 1173 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ERLIN1O75477 346 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF202O95125 648 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 REXO1L1PQ8IX06 675 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 HINFPQ9BQA5 517 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CLIC4Q9Y696 253 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ATP2B1P20020 1258 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 PACS2Q86VP3 889 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CBFA2T2O43439 604 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 FUT8Q9BYC5 575 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms