RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 NFIAQ12857 509 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 VGLL4Q14135 290 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 GORABQ5T7V8 394 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 IFNL1Q8IU54 200 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 PANK1Q8TE04 598 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 SSH3Q8TE77 659 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 OPTNQ96CV9 577 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 USP40Q9NVE5 1235 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 GPR25O00155 361 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 PI16Q6UXB8 463 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 FAM151AQ8WW52 585 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 CSADQ9Y600 493 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 ALDH1A1P00352 501 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 WRNIP1Q96S55 665 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 SPATA5Q8NB90 893 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 HOOK2Q96ED9 719 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 GAKO14976 1311 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 OTOFQ9HC10 1997 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 PTPN18Q99952 460 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-211ENST00000482015 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 MECOMQ03112 1051 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 TNNI3KQ59H18 835 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 DCAF15Q66K64 600 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 OTUD5Q96G74 571 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 FKTNO75072 461 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 MCAMP43121 646 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 SLF2Q8IX21 1173 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 ZNF384Q8TF68 577 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 GPR108Q9NPR9 543 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 BTDP43251 543 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 CEP85Q6P2H3 762 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 INPP5BP32019 993 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 RGS3P49796 1198 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 GTF2A2P52657 109 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 IDI2Q9BXS1 227 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 SNRKQ9NRH2 765 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 CRHR2Q13324 411 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 CCL15Q16663 113 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 ERO1BQ86YB8 467 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 RAI14Q9P0K7 980 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 ENTPD3O75355 529 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 IRF6O14896 467 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 MS4A1P11836 297 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 PICALMQ13492 652 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-211ENST00000482015 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 RHBDL3P58872 404 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 GSTO1P78417 241 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 COG6Q9Y2V7 657 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms